bwin中国公司正在开拓用于药物发现的新信息学工具. bwin国际官方网站相信开源和全球合作的力量会带来更大的好处. 加入bwin国际官方网站,帮助世界各地的患者.

Peax

Peax是一个基于自动编码器的无监督机器学习的交互式概念学习和表观基因组模式探索工具.

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Jenkins-LSCI

Jenkins-LSCI使研究人员能够在与Jenkins-CI(广泛使用的支持构建的持续集成服务器)相同的健壮框架和插件生态系统上构建工作流和数据管道, 部署和自动化任何软件项目.

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Habitat

Habitat是一个简单但功能强大的自包含对象存储管理系统. 基于亚马逊网络服务,它能够提供几乎无限的存储空间. 而不是一个大型的集中管理系统, Habitat可以用作单个应用程序的本地存储库,也可以与许多客户机共享和使用.

Habitat最适合于这样的情况:文件的客户机生产者和消费者不需要文件系统协议接口,可以使用http访问存储.

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YADA

Access any data, at any source, in any format, 从任何环境, 只使用URL, 只有一次配置.

从多个来源获取数据, 不同的格式, 将结果合并为一个具有统一列名的结果, on-the-fly, using one URL.

建立être的原因是为了提高效率, 非冗余开发依赖于数据的应用程序和实用程序, 数据源查询, data analysis, 处理管道, extract, transform, 并加载(ETL)进程, etc. YADA完成了所有这些工作,同时保持了数据访问与应用程序架构的其他方面(如用户界面)之间的完全解耦.

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OntoBrowser

开发OntoBrowser工具是为了管理本体和代码列表. 该工具的主要目标是为专家管理员提供一个在线协作解决方案,将代码列表术语(来自多个系统/数据库)映射到首选本体术语. 其他关键特性包括分层/图形格式的本体可视化, 高级搜索功能, 同行评审/批准工作流和web服务访问数据.

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Railroadtracks

Railroadtracks是一个Python工具包,用于处理诸如生物信息学管道中的相关任务的图形.

它是为比较RNA-Seq管道而创建的,并发现它在其他情况下使用, 比如为NGS数据的QC编写一个灵活的系统.

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又一条管道

YAP是一个可扩展的并行框架,使用Python编写 OpenMPI libraries. 它允许研究人员快速构建高吞吐量的大数据管道,而无需广泛的并行编程知识. 用户通过简单的配置文件与框架交互,以捕获分析参数和用户导向的元数据, 实现可重复性研究. 使用YAP,分析人员已经能够实现高达36× in的显著速度提升 RNASeq 工作流执行时间.

YAP的设计具有可伸缩性和灵活性. bwin国际官方网站已经实施了YAP,重点是下一代测序(NGS)。, 以应对NIBR的大数据处理挑战. 然而,该框架可以很容易地适用于任何类型的分析. 它可以在本地Linux工作站或大型HPC集群系统上执行. 该框架通过实现最优的数据处理机制(如, 并行数据分布, 避免使用数据流和命名管道的文件I/O.

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RDKit

RDKit是一个化学信息学和机器学习软件的集合,用c++和Python编写. 核心算法和数据结构是用c++编写的. 提供了包装器来使用来自Python、Java或c#的工具包. Additionally, RDKit发行版包括一个基于postgresql的磁带,允许分子存储在关系数据库中,并通过子结构和相似性搜索进行检索.

Please see the RDKit文档 有关安装、使用、烹饪书等更多信息.

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GridVar

gridar是一个jQuery插件,可以将多维数据集可视化为以行-列格式组织的层. At each cell (i.e., (行与列交点处的矩形), gridar将数据显示为背景色(如彩色/热图)和/或字形(形状)。. 这使得数据集的不同特征可以层叠在一起. 有关使用的更多信息, 必需的库, 以及其他开发者信息, 请参阅bwin国际官方网站在GitHub上的文档.

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